Лазарев Вениамин Викторович - ассистент кафедры дерматовенерологии,
ул. им. Митрофана Седина, д. 4, г. Краснодар, 350063
Venyamyn V. Lazarev - Assistant of the Department of Dermatovenerology,
Mitrofana Sedina str., 4, Krasnodar, 350063
Тлиш Марина Моссовна - доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой дерматовенерологии,
ул. им. Митрофана Седина, д. 4, г. Краснодар, 350063
Marina M. Tlish - Dr. Sci. (Med.), Professor (academic title), Head of the Department of Dermatovenerology,
Mitrofana Sedina str., 4, Krasnodar, 350063
Шавилова Марина Евгеньевна - кандидат медицинских наук, ассистент кафедры дерматовенерологии,
ул. им. Митрофана Седина, д. 4, г. Краснодар, 350063
Шавилова Марина Евгеньевна - кандидат медицинских наук, ассистент кафедры дерматовенерологии,
Mitrofana Sedina str., 4, Krasnodar, 350063
Введение. Микробиота кожи каждого человека уникальна и включает разнообразное резидентное и транзиторное сообщество, композиция которого определяется строго индивидуально. Данное исследование направлено на идентификацию геномов микроорганизмов кожи у пациентов с хронической микробной экземой.
Цель исследования: оценить клиническую эффективность комплексной терапии больных микробной экземой с персонализированным подбором топических антибактериальных средств с учетом определения антибиотикорезистентности методом полногеномного секвенирования.
Методы. В проспективном сравнительном рандомизированном исследовании приняли участие 60 больных микробной экземой в стадии обострения, которые случайным образом были разделены на две группы по 30 человек: основную и сравнения. В группе сравнения (группа 2, n = 30) пациентам проводили терапию согласно Федеральным клиническим рекомендациям. В основной группе (группа 1, n = 30) пациентов также проводилась традиционная терапия, при этом топические антибактериальные средства были подобраны персонализировано на основе данных антибиотикорезистентности. На 21-й день терапии пациентам обеих групп в схему лечения был добавлен эмолент с пробиотическим компонентом. Больные проходили терапию, наблюдение и обследование на базе кафедры дерматовенерологии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Кубанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации. Клиническое исследование выполнено в период с декабря 2023 по декабрь 2024 года. Сроки наблюдения в исследовании были разделены на несколько этапов: до начала терапии, на 14-й, 21-й дни и спустя 6 месяцев после лечения. В работе проводился сравнительный анализ микробиома пораженных участков кожи у больных и оценивалось влияние топического антибактериального препарата, подобранного на основе данных полногеномного секвенирования. Лабораторный этап настоящего исследования выполнен на двух базах: клинико-диагностическая лаборатория «CL Lab» (общество с ограниченной ответственностью «СЛ Медикалгруп») г. Краснодара и генетическая лаборатория «Сербалаб» (общество с ограниченной ответственностью «Сербалаб») в г. Санкт-Петербурге. Для оценки кожного патологического процесса использовали индекс площади поражения и тяжести атопического дерматита (Eczema Area and Severity Index, EASI). Статистическая обработка данных производилась с использованием статистического пакета Statistica 12.0 (StatSoft, США) и Microsoft Exel 2010 (Microsoft, США). Статистическое описание количественных показателей осуществлялось с помощью медианы и квартилей (Me (Q1; Q3)) и среднего со стандартным отклонением (М ± SD). Статистически значимыми различия считали при уровне ошибки р < 0,05.
Результаты. Во время обострения у больных хронической микробной экземой наблюдалось смещение микробного равновесия в сторону увеличения микроорганизмов Staphylococcus aureus, Clostridioides diffi cile, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, присутствующих на пораженных участках кожи, при этом количество функциональных бактерий было ограничено. Уже на 14-й день была отмечена более выраженная тенденция к восстановлению здорового микробиома у пациентов основной группы. К 6-му месяцу лечения у пациентов основной группы наблюдалось большее снижение микробной колонизации в очагах поражения микробной экземы, чем в группе сравнения, а доля функционалов Bifi dobacterium и Lactobacillus была увеличена по сравнению со значениями до лечения в 2,31 и 2,10 раза соответственно. При этом в основной группе рецидив заболевания произошел у 2 пациентов (против 5 в группе сравнения), что может говорить о большей эффективности предложенного в исследовании метода терапии.
Заключение. Метод полногеномного секвенирования позволяет определить таксономическое разнообразие микробиома. Персонализированное применение топического антибактериального средства в комплексной терапии в основной группе пациентов способствует более быстрому восстановлению здорового микробиома кожи, чем в группе сравнения.
Background. Each individual has a unique skin microbiota that includes a diverse resident and transient community displaying an individualized composition. This study focuses on the identification of skin microbial genomes in patients with chronic microbial eczema.
Objective. To evaluate the clinical efficacy of complex therapy in patients with microbial eczema using personalized selection of topical antibacterial agents while taking into account the determination of antibiotic resistance by whole genome sequencing.
Methods. The prospective сomparative randomized study involved 60 patients with microbial eczema in the exacerbation stage, who were randomly divided into two groups of 30 people each: main and control groups. In the control group (group 2, n = 30) patients were treated according to the Federal Clinical Guidelines. In the main group (group 1, n = 30) patients were also treated with conventional therapy, while topical antibacterial agents were selected in a personalized manner based on antibiotic resistance data. On the 21st day of therapy, an emollient with a probiotic component was added to the treatment regimen for patients of both groups. The patients underwent therapy, observation, and examination at the Department of Dermatovenerology of the Kuban State Medical University of the Ministry of Health of the Russian Federation. The clinical study was performed between December 2023 and December 2024. The observation periods in the study were divided into several stages: before the start of therapy, on days 14, 21, and six months after treatment. In this study, the microbiome of the affected skin areas of the patients was analyzed comparatively, and the effect of topical antibacterial preparation selected on the basis of whole genome sequencing data was evaluated. The laboratory stage of the present study was conducted at two sites: CL Lab Clinical Diagnostic Laboratory (“СL Medicalgroup” LLC) in Krasnodar and Serbalab Genetic Laboratory (“Serbalab” LLC) in St. Petersburg. The Eczema Area and Severity Index (EASI) was used to evaluate the skin pathologic process. Statistical processing of data was performed using the Statistica 12.0 software package (StatSoft, USA) and Microsoft Exel 2010 (Microsoft, USA). Quantitative parameters were statistically described using median and quartiles (Me (Q1;Q3)), along with mean with standard deviation (M ± SD). Differences were considered statistically significant at the error level of p < 0.05.
Results. During exacerbation in patients with chronic microbial eczema, the microbial equilibrium shifted towards an increase in microorganisms Staphylococcus aureus, Clostridioides difficile, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli that were present on the affected skin areas, while the number of functional bacteria was limited. A more pronounced tendency to restoration of healthy microbiome in the patients of the main group was observed as soon as the 14th day. By the 6th month of treatment, the patients of the main group experienced a greater decrease in microbial colonization in the foci of microbial eczema lesions than in the control group, whereas the proportion of Bifidobacterium and Lactobacillus functionalis was increased compared to the pre-treatment values by 2.31 and 2.10 times, respectively. In addition, the disease relapse occurred in two patients in the main group (versus five in the control group), which may indicate the higher efficacy of the therapy method proposed in the study.
Conclusion. Whole genome sequencing method identifies the taxonomic diversity of the microbiome. Personalized application of topical antibacterial agent in complex therapy in the main group of patients promotes faster restoration of healthy skin microbiome than in the control group.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.