Возможности персонализированного подбора топических антибактериальных средств у больных микробной экземой на основе данных полногеномного секвенирования: проспективное сравнительное рандомизированное исследование

Введение. Микробиота кожи каждого человека уникальна и включает разнообразное резидентное и транзиторное сообщество, композиция которого определяется строго индивидуально. Данное исследование направлено на идентификацию геномов микроорганизмов кожи у пациентов с хронической микробной экземой.

Цель исследования: оценить клиническую эффективность комплексной терапии больных микробной экземой с персонализированным подбором топических антибактериальных средств с учетом определения антибиотикорезистентности методом полногеномного секвенирования.

Методы. В проспективном сравнительном рандомизированном исследовании приняли участие 60 больных микробной экземой в стадии обострения, которые случайным образом были разделены на две группы по 30 человек: основную и сравнения. В группе сравнения (группа 2, n = 30) пациентам проводили терапию согласно Федеральным клиническим рекомендациям. В основной группе (группа 1, n = 30) пациентов также проводилась традиционная терапия, при этом топические антибактериальные средства были подобраны персонализировано на основе данных антибиотикорезистентности. На 21-й день терапии пациентам обеих групп в схему лечения был добавлен эмолент с пробиотическим компонентом. Больные проходили терапию, наблюдение и обследование на базе кафедры дерматовенерологии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Кубанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации. Клиническое исследование выполнено в период с декабря 2023 по декабрь 2024 года. Сроки наблюдения в исследовании были разделены на несколько этапов: до начала терапии, на 14-й, 21-й дни и спустя 6 месяцев после лечения. В работе проводился сравнительный анализ микробиома пораженных участков кожи у больных и оценивалось влияние топического антибактериального препарата, подобранного на основе данных полногеномного секвенирования. Лабораторный этап настоящего исследования выполнен на двух базах: клинико-диагностическая лаборатория «CL Lab» (общество с ограниченной ответственностью «СЛ Медикалгруп») г. Краснодара и генетическая лаборатория «Сербалаб» (общество с ограниченной ответственностью «Сербалаб») в г. Санкт-Петербурге. Для оценки кожного патологического процесса использовали индекс площади поражения и тяжести атопического дерматита (Eczema Area and Severity Index, EASI). Статистическая обработка данных производилась с использованием статистического пакета Statistica 12.0 (StatSoft, США) и Microsoft Exel 2010 (Microsoft, США). Статистическое описание количественных показателей осуществлялось с помощью медианы и квартилей (Me (Q1; Q3)) и среднего со стандартным отклонением (М ± SD). Статистически значимыми различия считали при уровне ошибки р < 0,05.

Результаты. Во время обострения у больных хронической микробной экземой наблюдалось смещение микробного равновесия в сторону увеличения микроорганизмов Staphylococcus aureus, Clostridioides diffi cile, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, присутствующих на пораженных участках кожи, при этом количество функциональных бактерий было ограничено. Уже на 14-й день была отмечена более выраженная тенденция к восстановлению здорового микробиома у пациентов основной группы. К 6-му месяцу лечения у пациентов основной группы наблюдалось большее снижение микробной колонизации в очагах поражения микробной экземы, чем в группе сравнения, а доля функционалов Bifi dobacterium и Lactobacillus была увеличена по сравнению со значениями до лечения в 2,31 и 2,10 раза соответственно. При этом в основной группе рецидив заболевания произошел у 2 пациентов (против 5 в группе сравнения), что может говорить о большей эффективности предложенного в исследовании метода терапии.

Заключение. Метод полногеномного секвенирования позволяет определить таксономическое разнообразие микробиома. Персонализированное применение топического антибактериального средства в комплексной терапии в основной группе пациентов способствует более быстрому восстановлению здорового микробиома кожи, чем в группе сравнения.

1. Силина Л.В., Шварц Н.Е. Микробиом кожи при микробной экземе. Клиническая дерматология и венерология. 2019;18(1):49–55. https://doi.org/10.17116/klinderma20191801149

2. Hülpüsch C, Rohayem R, Reiger M, Traidl-Hoffmann C. Exploring the skin microbiome in atopic dermatitis pathogenesis and disease modification. J Allergy Clin Immunol. 2024;154(1):31–41. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2024.04.029

3. Salem I, Ramser A, Isham N, Ghannoum MA. The Gut Microbiome as a Major Regulator of the Gut-Skin Axis. Front Microbiol. 2018;9:1459. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01459

4. Widhiati S, Purnomosari D, Wibawa T, Soebono H. The role of gut microbiome in inflammatory skin disorders: A systematic review. Dermatol Reports. 2021;14(1):9188. https://doi.org/10.4081/dr.2022.9188

5. Ahmad F, Alam MA, Ansari AW, Jochebeth A, Leo R, Al-Abdulla MN, Al-Khawaga S, AlHammadi A, Al-Malki A, Al Naama K, Ahmad A, Buddenkotte J, Steinhoff M. Emerging Role of the IL-36/IL-36R Axis in Multiple Inflammatory Skin Diseases. J Invest Dermatol. 2024;144(2):206–224. https://doi.org/10.1016/j.jid.2023.11.004

6. Роживанова Т.А., Полеско И.В., Щербакова М.Ю. Современные представления о микробиоценозе кожи и кишечника у больных экземой и метаболическим синдромом. Клиническая дерматология и венерология. 2015;14(2):11–16. https://doi.org/10.17116/klinderma201514211-16

7. Kobayashi T, Nagao K. Host-microbial dialogues in atopic dermatitis. Int Immunol. 2019;31(7):449–456. https://doi.org/10.1093/intimm/dxz026

8. Ковалева Ю.С., Комкина Н.Г. Микробная экзема — триггерные точки воздействия. Медицинский совет. 2023;17(2):37–44. https://doi.org/10.21518/ms2022-031.

9. Baviera G, Leoni MC, Capra L, Cipriani F, Longo G, Maiello N, Ricci G, Galli E. Microbiota in healthy skin and in atopic eczema. Biomed Res Int. 2014;2014:436921. https://doi.org/10.1155/2014/436921

10. Murzina E, Kaliuzhna L, Bardova K, Yurchyk Y, Barynova M. Human Skin Microbiota in Various Phases of Atopic Dermatitis. Acta Dermatovenerol Croat. 2019;27(4):245–249.

11. Кузнецов К.О., Тукбаева Л.Р., Казакова В.В., Мирзоева К.Р., Богомолова Е.А., Салахутдинова А.И., Пономарева Д.Ю., Гарипова А.Р., Муцольгова М.С.-М., Галимханов А.Г., Сахибгареев М.И., Гужвиева Э.Р. Влияние COVID-19 на антибиотикорезистентность в педиатрической популяции. Педиатрическая фармакология. 2022;19(6):503–513. http://dx.doi.org/10.15690/pf.v19i6.2465

12. Shah RA, Hsu JI, Patel RR, Mui UN, Tyring SK. Antibiotic resistance in dermatology: The scope of the problem and strategies to address it. J Am Acad Dermatol. 2022;86(6):1337–1345. https://doi.org/10.1016/j.jaad.2021.09.024

13. Miller AC, Adjei S, Temiz LA, Tyring SK. Antibiotic Resistance in Dermatology Part 1: Mechanisms of Resistance. Skin Therapy Lett. 2023;28(1):7–10

14. Stracy M, Snitser O, Yelin I, Amer Y, Parizade M, Katz R, Rimler G, Wolf T, Herzel E, Koren G, Kuint J, Foxman B, Chodick G, Shalev V, Kishony R. Minimizing treatment-induced emergence of antibiotic resistance in bacterial infections. Science. 2022;375(6583):889–894. https://doi.org/10.1126/science.abg9868

15. Bin L, Malley C, Taylor P, Preethi Boorgula M, Chavan S, Daya M, Mathias M, Shankar G, Rafaels N, Vergara C, Potee J, Campbell M, Hanifin JM, Simpson E, Schneider LC, Gallo RL, Hata T, Paller AS, De Benedetto A, Beck LA, Ong PY, Guttman-Yassky E, Richers B, Baraghoshi D, Ruczinski I, Barnes KC, Leung DYM, Mathias RA. Whole genome sequencing identifies novel genetic mutations in patients with eczema herpeticum. Allergy. 2021 Aug;76(8):2510–2523. https://doi.org/10.1111/all.14762

16. Олисова О.Ю., Свитич О.А., Поддубиков А.В., Вартанова Н.А., Потапова М.Б. Микробиологическая оценка эффективности стандартной терапии при атопическом дерматите. Вестник дерматологии и венерологии. 2023;99(3):44–52. https://doi.org/10.25208/vdv1364

17. Fölster-Holst R. The role of the skin microbiome in atopic dermatitis - correlations and consequences. J Dtsch Dermatol Ges. 2022;20(5):571– 577. https://doi.org/10.1111/ddg.14709

18. Тлиш М.М., Кузнецова Т.Г., Наатыж Ж.Ю, Псавок Ф.А. Микробная экзема: возможности коррекции на современном этапе. Вестник дерматологии и венерологии. 2018;94(4):60–67. https://doi.org/10.25208/0042-4609-2018-94-4-60-67

19. Hanifin JM, Baghoomian W, Grinich E, Leshem YA, Jacobson M, Simpson EL. The Eczema Area and Severity Index-A Practical Guide. Dermatitis. 2022;33(3):187–192. https://doi.org/10.1097/DER.0000000000000895

20. Муравьева А.С., Лыков И.Н. Медико-экологические аспекты антибиотикорезистентности микробиома кожи у членов семьи. Проблемы региональной экологии. 2023;3:27–31. https://doi.org/10.24412/1728-323X-2023-3-27-32

21. Пирузян АЛ, Невозинская ЗА, Корсунская ИМ. Кожные бактериальные инфекции— всегда актуальная проблема. Медицинский Совет. 2021;8:63–66. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2021-8-63-66

22. Тараско А.Д. Хроническая глубокая рецидивирующая пиодермия в амбулаторной практике хирурга. Амбулаторная хирургия. 2021;18(2):144–150. https://doi.org/10.21518/1995-1477-2021-18-2-144-150

23. Тлиш М.М., Попандопуло Е.К. Оценка эффективности применения ультратонотерапии у больных микробной экземой. Вопросы курортологии, физиотерапии и лечебной физической культуры. 2022;99(5):48–53. https://doi.org/10.17116/kurort20229905148

24. Mlynarczyk-Bonikowska B, Kowalewski C, Krolak-Ulinska A, Marusza W. Molecular Mechanisms of Drug Resistance in Staphylococcus aureus. Int J Mol Sci. 2022;23(15):8088. https://doi.org/10.3390/ijms23158088

25. Xie J, Li M, Yang S, Dong Q. Topical administration of mupirocin ointment and fusidic acid in bacterial infection-induced skin diseases. Postepy Dermatol Alergol. 2025;42(1):42–46. https://doi.org/10.5114/ada.2024.145185

26. Chu DK, Chu AWL, Rayner DG, Guyatt GH, Yepes-Nuñez JJ, Gomez-Escobar L, Pérez-Herrera LC, Díaz Martinez JP, Brignardello-Petersen R, Sadeghirad B, Wong MM, Ceccacci R, Zhao IX, Basmaji J, MacDonald M, Chu X, Islam N, Gao Y, Izcovich A, Asiniwasis RN, Boguniewicz M, De Benedetto A, Capozza K, Chen L, Ellison K, Frazier WT, Greenhawt M, Huynh J, LeBovidge J, Lio PA, Martin SA, O’Brien M, Ong PY, Silverberg JI, Spergel JM, Smith Begolka W, Wang J, Wheeler KE, Gardner DD, Schneider L. Topical treatments for atopic dermatitis (eczema): Systematic review and network meta-analysis of randomized trials. J Allergy Clin Immunol. 2023;152(6):1493–1519. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2023.08.030

27. Коцур Ю.М., Черных Т.Ф., Флисюк Е.В., Наркевич И.А. Разработка состава топической формы производного тиадиазола. Разработка и регистрация лекарственных средств. 2024;13(4):121–128. https://doi.org/10.33380/2305-2066-2024-13-4-1931

28. Lax SJ, Van Vogt E, Candy B, Steele L, Reynolds C, Stuart B, Parker R, Axon E, Roberts A, Doyle M, Chu DK, Futamura M, Santer M, Williams HC, Cro S, Drucker AM, Boyle RJ. Topical Anti-Inflammatory Treatments for Eczema: A Cochrane Systematic Review and Network Meta-Analysis. Clin Exp Allergy. 2024;54(12):960–972. https://doi.org/10.1111/cea.14556